謝長廷日前在回應該事件時稱，過去八年來雖有臺灣漁船被驅離，但遭逮捕這是第一次，他深感遺憾，還說“我的任期也快到了，要講一點得罪人的話”，那就是“不該縱容少數(shù)違規(guī)漁船，破壞臺灣與大多數(shù)漁業(yè)界的利益”。言論一出即刻遭到輿論批評。有臺網友諷刺“果真‘助日代表’”，中時新聞網更是直言謝長廷“不演了”。

　　臺媒稱，針對漁船遭扣押一事，經臺“漁業(yè)署”協(xié)調，由蔡姓船東匯出600.6萬日元(約合人民幣27萬元)后，船只及人員才于5日傍晚獲釋，船東痛批日方像土匪，“要錢才放人”，也不滿民進黨當局護漁不夠強硬。

　　船東喊冤稱，漁船當下作業(yè)的海域，應是重疊經濟海域，沒有越界問題，但人、船卻均被扣。目前正值魚汛期，漁船會在海上繼續(xù)作業(yè)，7月16日后才會返港。他還表示，出海一趟的油錢加上其它費用要60多萬新臺幣(約合人民幣13.4萬元)，現(xiàn)在還被罰錢，要再捕撈回本，否則血本無歸。